Финальный пост

Всем привет!

Как видите, это живой журнал мертв. Возможно, через год или два я продолжу писать куда-нибудь еще. Если вам это интересно, пожалуйста, оставайтесь, я здесь об этом сообщу.

Всем спасибо!

Карен

Воскресный перепост про эффект плацебо

Это офигенно.

Добавлю лишь прекрасный коммент из исходного поста: "что характерно, помогает не гомеопатия сама по себе, а «хороший гомеопат» (см. группу Augmented)."

* * *

Оригинал взят у_hellmaus_в post
Потрясающая статья в журнале PLoS One: http://www.plosone.org/article/info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pone.0048135

Команда медиков из Harvard Medical School нашла ген, от которого зависит восприимчивость человека к эффекту плацебо (лечение внушением, например, когда пациенту дают таблетки без активных веществ, а ему становится лучше).

Ген этот кодирует фермент катехол-О-метилтрансферазу, который разрушает нейромедиатор (сигнальное вещество) дофамин, и среди людей встречаются два варианта гена. Варианты фермента, кодируемые вариантами гена, отличаются 158-ой аминокислотой - это может быть метионин и валин.

Так вот, люди с двумя копиями 158Val плацебо не подвержены, с двумя копиями 158Met прекрасно выздоравливают от плацебо, а обладатели обоих типов фермента реагируют на плацебо, но слабее чем пациенты с чистым 158Met. Правда,  это показано пока только на одной болезни - синдроме раздраженного кишечника.


Причем для владельцев изоформы 158Met важно не столько само плацебо, сколько участие и внимание врача: на диаграмме Limited - это пациенты, получавшие плацебо в стиле "выпили таблеточку? Хорошо! Следующий!", а Augmented - те, с которыми врач устанавливал личный контакт, выражал участие и уверенность в успехе лечения. 

Млечный путь

Наткнулся на прекрасную 25ГБ-фотографию центра нашей галактики.

Здесь оригинал, а здесь ее адаптированный для просмотра вариант, нужен только достаточно быстрый интернет: http://www.eso.org/public/images/eso1242a/zoomable/

Можно потратить часы, гуляя по этой фотке, это невозможно красиво, по-моему.




Особенно доставляет зазумиться куда-нибудь сильно, подождать, пока все детали подгрузятся, а потом отдаляться до предела.




Вдобавок хочу поделиться этим видео - оно сделано на основе реальных данных о координатах разных галактик. Нужно включить максимальное качество и на полный экран.

Флуоресцентные белки. Часть 0

Пока я пытаюсь обстоятельно написать о том, чем прекрасны флуоресцентные белки и что мы можем с их помощью увидеть, хочу поделиться этим видео.

На нем показана жизнь культуры человеческих клеток HeLa (http://ru.wikipedia.org/wiki/HeLa), которые производят особый сенсор из флуоресцентных белков, показывающий, в какой фазе клеточного цикла находится в данный момент клетка.

Клеточный цикл - это время, которое клетка живет от одного деления до другого, и за это время она проходит различные фазы - фазу деления, фазу роста, фазу копирования ДНК и фазу подготовки к делению. Кроме деления, ни одна фаза визуально не отличается от другой. Если же клетка производит сенсор, она становится красной во время фазы роста и зеленой - во все остальные.

На видео видно, например, как сначала клетки делились синхронно, но постепенно рассинхронизировались.




Сенсор можно наблюдать и в целом трансгенном организме.

Вот эмбрион рыбы:


И срезы мозга мыши:

 
Исходная статья с описанием сенсора

ЦЕРН

За месяц я успел дважды побывать в ЦЕРНе, и все благодаря Андрею (snoop58), который был супердобр и потратил кучу своего времени, чтобы все нам рассказать и показать.

ЦЕРН - огромный физический исследовательский центр, который был создан вскоре после второй мировой войны и посвящен исследованиям в области физики высоких энергий. ЦЕРН - как город, одновременно здесь работают около 10 000 физиков, в 1989-93 годах здесь появился на свет интернет, но в свете последних новостей он известен, прежде всего, как место «Наблюдения превышения количества событий в процессе поиска стандартного хиггсовского бозона» на Большом адронном коллайдере (LHC).



Если резюмировать, то больше всего меня впечатлила общая атмосфера заведения. Десять тысяч человек работают над одной глобальной задачей, каждый завинчивает в ее решение свой маленький винтик, уровень внутренней конкуренции  - минимальный. Team work, в натуре. В биологии такого или нет, или почти нет.

Collapse )

Рейтинг

Опубликован рейтинг университетов мира. Из него следует, что учиться нужно или в США, или в Великобритании: в первой двадцатке лишь один раз мелькнула Швейцария (13ое место) и в конце списка дважды - Канада.

Сейчас, конечно, все российские деятели кинутся критиковать методы, по которым составляются подобные рейтинги, но все же не вызывает сомнений, что МГУ (116ое место, лучший российский ВУЗ) даже рядом не стоит с топовыми университетами - какими бы методами его не оценивали.

Садовничий, конечно, так не считает (http://www.1tv.ru/prj/pozner/vypusk/4617, позапрошлогодний коммент):

Научно-популярные приложения

Подскажите, пожалуйста, какие-нибудь научно-популярные приложения для айпадов-айфонов.

Вот есть "Molecules" - позволяет просматривать пространственные структуры молекул.





Есть прекрасные, но дорогие "The Elements: A Visual Exploration"
(обзор: 
http://www.youtube.com/watch?v=opcyYWSJ8ng&feature=related)




Есть несколько астрономических приложений (вот, например, NASA app)



Есть неплохой "Click and learn" - про основные биологические вопросы с анимацией и видео.



Есть обучающее "Virtual cell animations", а также "Cell Imaging HD" с красивыми картинками клеток под микроскопом.


Что еще? Есть ли что-нибудь на русском?

Спасибо.

Происхождение человека. Часть 2. Почему мы считаем, что человек произошел от обезьян?

У меня не вызывает никаких отрицательных эмоций мысль о том, что моими далекими предками были обезьяны. Наоборот, возникает какое-то теплое чувство от того, что и у меня, и у обезьян, и у всего остального живого на Земле – у деревьев, у птиц, у бактерий и т.д. – общее происхождение и общая история в миллионы лет.

Обезьяны – удивительные существа. Уровень интеллекта у шимпанзе и горилл – на уровне наших трехлетних детей (у некоторых - даже выше). Все человекообразные обезьяны используют орудия, чтобы решать встающие перед ними задачи, они отлично понимают, что такое прошлое и будущее и планируют свое будущее (http://elementy.ru/news/430244), у них есть чувство юмора (http://ru.wikipedia.org/wiki/Коко_(горилла)), они способны к бескорыстной взаимопомощи (http://elementy.ru/news/430155) и к сопереживанию. Некоторые исследователи даже считают, что гориллы испытывают что-то вроде сложных духовных и религиозных чувств (http://en.wikipedia.org/wiki/Dawn_Prince-Hughes)

Человекообразные обезьяны хорошо обучаются языку глухонемых. Один из наиболее ярких примеров - горилла Коко (http://ru.wikipedia.org/wiki/Коко_(горилла)), выучившая на нем больше 1000 слов и вдобавок понимающая около 2000 английских слов на слух.

Вот видео, как Коко смотрит свой любимый фильм «Чай с Муссолини» (досмотрите до конца):


Еще одно интересное видео с ней:


Документальный фильм о Коко. 
Другие подобные примеры: шимпанзе Уошо, бонобо Канзи.

Одно из моих самых сильных впечатлений последних лет – часовое наблюдение за жизнью небольшой семьи горных горилл в лесу на границе Уганды и Руанды.

Я как бы все понимал до того. Что мы с обезьянами очень близки, что у нас есть общие черты социального поведения, что мимика похожа.. Но когда я наблюдал за этим часом их совместной жизни, у меня было глубокое впечатление, что передо мной люди.



* * *

Но это все лирика.
Почему на самом деле мы считаем, что человек произошел от обезьян? 
(здесь надо подчеркнуть, что, конечно, не от современных обезьян, с современными обезьянами мы имеем лишь общего предка, который тоже был обезьяной)

1. Да это же очевидно!

2. ДНК
Как я уже писал (http://labjournalcom.livejournal.com/9984.html), сравнение последовательностей ДНК разных организмов позволяет судить о том, какие организмы более родственны друг другу, а какие - менее. Проводя аналогию с генеалогическим древом, сравнение ДНК позволяет отличить среди биологических видов родных братьев от двоюродных, троюродных и дальних родственников.

Анализ ДНК точно определяет место человека в животном мире. Точно так же, как это произошло и с астрономией, когда Земля сначала оказалась не центром Солнечной системы, а потом и Солнечная система оказалась лишь на задворках одной из миллионов галактик, человек оказался не каким-то там специальным созданием Бога, и даже не венцом эволюции. Просто одним из миллионов видов - точно таких же, как и он, венцов.

Нашими ближайшими родственниками являются шимпанзе и горилла, вместе с ними мы принаждежим к отряду приматов, который входит в класс млекопитающих и т.д. Об этом я уже писал в первой части поста - http://labjournalcom.livejournal.com/12982.html.



Вдобавок к сравнению последовательности нашей ДНК с существующими видами, в последние годы ученые научились выделять и определять последовательность ДНК из палеонтологических находок (что невообразимо круто). В 2010 году мы узнали геном неандертальца (http://elementy.ru/news/431316), в 2011 – геном денисовца (http://elementy.ru/news/431483) - это виды людей, жившие когда-то на Земле одновременно с нами.

Теперь мы глубже понимаем, что происходило в прошлом с нашими предками – например, теперь ясно, что мы не просто вытеснили неандертальцев – мы (все, кроме африканцев) с ними смешались. Неожиданно стали известны и другие прикольные факты.

3. Палеонтологические находки
Первые палеонтологические находки похожих на человека существ и используемых ими каменных орудий были обнаружены в XIX веке. С тех пор их количество все увеличивается и увеличивается. В последние 15 лет в этой области произошел настоящий прорыв, который позволил нам гораздо детальнее заглянуть в собственную историю.

Была найдена масса переходных форм между уже известными, были найдены другие виды людей, жившие когда-то одновременно с нашим. Выяснилось, что эволюция гоминид вовсе не была линейной, как изображается на всех картинках, а имела множество ветвей. Оказалось, что еще совсем недавно, 30-40 тысяч лет назад, на Земле одновременно жило как минимум четыре разных вида людей. Некоторые находки даже пролили свет на духовную жизнь наших предков (а также неандертальцев - http://elementy.ru/news/431693http://elementy.ru/news/431521).

4. Другие свидетельства
И хотя каждого из первых двух пунктов достаточно, чтобы однозначно говорить о том, кем были наши предки, картина дополняется бесчисленными примерами общности внутренней организации у нас и у животных (среди которых обезьяны, опять же, на нас больше похожи, чем все остальные).

Очень похожее эмбриологическое развитие, очень похожая физиология, внутриклеточное устройство вообще одно и то же, неожиданные проявления у нас животных черт (атавизмов) - с чего это все вдруг? 

Почему мы в эмбриональном развитии проходим через стадии, в которых у нас появляются жаберные мешки и хвост?



Почему наш геном отличается от генома гориллы, в основном, только единичными мутациями и дублированными генами? Почему у нас с гориллой в генах общие мутации, которых нет у других животных? Почему наш геном не представляет собой заново написанный божественный текст?

gl2_15

Заставлять Бога сфабриковывать все эти «совпадения», общие с обезьянами мутации в ДНК, палеонтологические находки и т.п мне кажется по меньшей мере неуважительным по отношению к нему. И католическая церковь, на мой взгляд, поступила единственно верно, когда официально признала существование эволюции и то, что тело человека (но не душа) произошло от «уже существовавшей живой материи» ("Pius XII stressed this essential point: if the human body takes its origin from pre-existent living matter the spiritual soul is immediately created by God", послание Иоанна Павла II с сайта Catholic Information Network  - http://www.cin.org/jp2evolu.html)

Позволю себе процитировать оттуда еще одну фразу Иоанна Павла II о теории эволюции:

"It is indeed remarkable that this theory has been progressively accepted by researchers, following a series of discoveries in various fields of knowledge. The convergence, neither sought nor fabricated, of the results of work that was conducted independently is in itself a significant argument in favour of this theory".

"Действительно замечательно, что, вслед за серией открытий в различных областях знания, эта теория все больше принималась исследователями. Сходство результатов независимо проведенных работ, не намеренное и не сфабрикованное, – само по себе является существенным аргументом в пользу этой теории".


Фактически признав теорию эволюции и происхождение человека от обезьян, католическая церковь, как мне кажется, сделала важный шаг, избавив себя одновременно и от необходимости изощряться в попытках опровергнуть науку, и от опасности выглядеть клоунами в глазах образованных верующих.

Может, и РПЦ когда-нибудь дорастет до этого?